Vrozené malformace
Existuje mnoho variant vrozených malformací (patologických změn). Tato problematika se týká zejména dětí. Z pohledu problematiky stomií jsou nejdůležitější malformace jako nevyvinutí jícnu (aplazie jícnu) či jeho neprůchodnost (atrézie jícnu), nevyvinutí řitního otvoru, neúplné vyvinutí močových cest, píštěle mezi trávicí soustavou a dýchací či močovou soustavou a mnoho dalších.